Viện Cơ Xương Khớp Bạch Mai, tiền thân là khoa Cơ Xương Khớp của Bệnh viện, được thành lập ngày 19 tháng 05 năm 1969 và Trung tâm Cơ Xương Khớp, được thành lập ngày 25 tháng 03 năm 2022. Trải qua gần 60 năm xây dựng và phát triển, dưới sự chỉ đạo sát sao, động viên, hỗ trợ của Đảng ủy, Ban Giám đốc Bệnh viện qua các thời kỳ, Viện đã không ngừng lớn mạnh và trở thành đơn vị đi đầu về chuyên khoa Cơ Xương Khớp tại Việt Nam.
Ngày 20 tháng 05 năm 2026, Giám đốc Bệnh viện Bạch Mai đã ký quyết định thành lập Viện Cơ Xương Khớp Bạch Mai trên cơ sở Trung tâm Cơ Xương Khớp của Bệnh viện. Sự ra đời của Viện Cơ Xương Khớp Bạch Mai là một bước ngoặt lớn giúp mở ra cơ hội và thúc đẩy sự phát triển toàn diện và thực hiện các chức năng của chuyên khoa trong giai đoạn mới và ở một tầm cao mới.
Viện Cơ Xương Khớp là cơ quan tham mưu chính của Bệnh viện Bạch Mai, Bộ Y tế trong định hướng phát triển ngành, công tác xây dựng các chương trình quản lý và phát triển chuyên khoa Cơ Xương Khớp cũng như công tác khám chữa bệnh cơ xương khớp trong cả nước.
Hiện nay, Viện có 86 cán bộ, viên chức bao gồm 37 bác sĩ, 42 điều dưỡng, 01 kĩ thuật viên Phục hồi chức năng, 03 trợ lý y khoa hỗ trợ chăm sóc, 02 thư kí y khoa. Viện có Đơn nguyên điều trị nội trú gồm 88 giường bệnh. Đơn nguyên Ngoại trú gồm 12 phòng khám bệnh chuyên khoa Cơ Xương Khớp, được bố trí tại 2 khu vực là Đơn vị khám, chữa bệnh theo yêu cầu và Đơn vị khám, chữa bệnh thường quy. Ngoài ra Viện còn có 11 Phòng/Đơn vị chức năng bao gồm 04 phòng siêu âm, 02 phòng tiêm khớp, 03 phòng đo mật độ xương, 02 phòng điện cơ, 01 phòng nội soi khớp, 01 phòng điều trị vận động và phục hồi chức năng. Với đội ngũ cán bộ có lòng nhiệt huyết, trình độ chuyên môn và kỹ năng cao, giàu kinh nghiệm, được tào tạo bài bản và chuyên sâu; hệ thống trang thiết bị tiên tiến, hiện đại; nhiều kỹ thuật chẩn đoán, điều trị cao và chuyên sâu, Viện Cơ Xương Khớp là địa chỉ tin cậy của người bệnh và đồng nghiệp trong cả nước. Viện Cơ Xương Khớp với niềm tự hào, lòng quyết tâm cao và sự đồng lòng, chúng tôi nguyện hiến dâng toàn bộ trí tuệ và sức lực cho sự phát triển của Bệnh viên, của Ngành y tế và sự nghiệp chăm sóc và bảo vệ sức khoẻ của nhân dân.